A Funatura está atuando no Projeto Cerrado Federal, de apoio às estratégias nacionais de redução do desmatamento e dos incêndiosflorestais no Cerrado Brasileiro. O objetivo é melhorar a capacidade do Ministério do Meio Ambiente na implementação do manejo integrado do fogo e do cadastramento ambiental rural em áreas selecionados do bioma Cerrado. As três Unidades de Conservação onde o projeto atua estão entre as mais afetadas por incêndios florestais no Brasil e no bioma Cerrado: Parque Nacional da Serra da Canastra ,Parque Nacional da Chapada da das Mesas e Refúgio de Vida Silvestre Veredas do Oeste Baiano.